目前，卵巢妊娠的病因尚无定论，但不排除以下因素：

I. 排卵障碍。一些妇科疾病会引起排卵障碍，如盆腔炎。这些炎症会造成盆腔及周围组织粘连，使卵子排出受阻。

二是输卵管受损。常见的就是因为一些外界因素或者先天发育造成的输卵管皮肤纤毛不能正常活动，或者引发输卵管蠕动，导致受精卵运输路径异常。

第三，输卵管表面条件有利于受精卵着床。当卵巢产生瘀血组织，或其表面有子宫内膜异位病变时，这些都有利于受精卵着床。

第四，机会学说。这种情况是说游泳的精子偶然发现卵巢表面有一个卵子可以与她结合，这相互结合，就发生了卵巢妊娠。

V. 放置宫内节育器。放置宫内节育器后，宫腔内的环境发生改变，恰好前列腺素增加或输卵管逆蠕动，导致卵巢怀孕。

第六，辅助生殖技术。体外受精将胚胎移植到女性体内后，容易发生宫外孕。